Une grande partie du budget de l'IASB provient de projets financés par des organismes externes.
Le service de comptabilité gère les finances de l’Institut, sous la supervision de la commission de gestion de l’Institut, de la Politique scientifique fédérale et de la Cour des comptes.
Par rapport aux autres instituts scientifiques fédéraux, une partie importante du budget de l’IASB (56%) provient de financements de projets concurrentiels d’organisations externes telles que:
- l’ESA
- EUMETSAT
- la Commission européenne
- des fonds de recherche nationaux (dans une moindre mesure)
L’ESA et PRODEX (ESA), avec une contribution de plus de 50% du financement de projets extérieurs, ainsi que le programme européen Copernicus sont des sources de revenus importantes pour l’Institut.